V skladu s členom 43(3) statuta Pannon ETZ sestavlja upravni odbor največ devet članov. Njegovi člani so predsednik občnega zbora in predstavniki osmih članov občnega zbora, ki jih izvoli občni zbor. Občni zbor voli dva člana predsedstva iz nacionalne strani, ki daje predsednika, in tri iz drugih nacionalnih strani. Teritorialno načelo pomeni razdelitev celotnega ozemlja Zveze na takšne enote, ki demokratično zagotavljajo gospodarsko in kulturno identiteto ločljivih večjih geografskih enot v delovanju Zveze in zagotavljajo, da nobena od nacionalnih strani ne more sprejemati zavezujoče odločitve za celotno Partnerstvo brez soglasja drugega.

Med funkcionarji, ki jih je izvolila občna skupščina, je bil predsednik – zastopan kot članica Baranjske županije, dr. László Őri - , kot tudi petim podpredsednikom - Lendva, Verőce-Drávamente, Eszék-Baranya, Somogy, Zala, kot članom, ki so zastopali županije Janezu Magyarju, Emini Kovač, Ivanu Anušiću, Norbertu Biróju in Imreju Pácsonyiju, je mandat potekel decembra. 17. 2023. Prav tako je 23. marca 2024 potekel mandat članoma nadzornega sveta Kálmánu Nagyju in Balázsu Kissu.

Občni zbor je soglasno sklenil, da za baranjskega župana izvoli dr. izvoli László Őri za podpredsednika, Emino Kovač zastopa županijo Verőce-Drávamente, Josipa Miletića zastopa Eszék-Baranya, Ratimirja Ljubića zastopa županijo Kapronca-Kőrös, Janeza Magyarja zastopa Lendva, Norberta Birója zastopa županija Somogy, Imré Pácsonyi zastopa županijo Zala. Poleg tega sta bila Kálmán Nagy in Balázs Kiss izvoljena za člana nadzornega sveta za obdobje 3 let.